Naprej na vsebino

Vse, kar morate vedeti o nigerijskem sevu

Spremembe so del vsakdana vsakega posameznika. Mutacije pa so del vsakega organizma, predvsem virusov. Covid-19 je do sedaj ustvaril kar nekaj mutacij, a v ospredju so britanski sev (v Sloveniji imamo potrjenih 62 primerov), južnoafriški sev (v Sloveniji imamo en sam potrjen primer) in brazilski sev. V zadnjih dneh se je pojavil tudi nigerijski sev.

Za vas smo poiskali zadnje raziskave in podatke o nigerijskem sevu.

Preberite tudi:

Britanski znanstveniki ugotavljajo, da je angleški sev verjetno smrtonosnejši

Potrjen prvi primer južnoafriškega seva

Nigerijski sev ali B 1.525

Z vsakim odkritjem nove različice SARS-CoV-2 se poglablja negotovost glede prihodnosti pandemije in sposobnosti nadzorovanja covida-19. Kako resna bo situacija, bo v prvi vrsti odvisno od tega, koliko različnih sevov oziroma mutacij se bo pojavilo, kako se bodo med seboj razlikovale, kakšne lastnosti bodo imele ter kako močno bodo kljubovale cepivom in že izoblikovani imunski zaščiti prebolelih.

Nigerijski sev ali B 1.525 je podoben že znanim sevom, ima pa kar nekaj mutacij, ki so lastne samo njemu.

Nigerijski sev ali B 1.525 je podoben že znanim sevom, ima pa kar nekaj mutacij, ki so lastne samo njemu.
Nigerijski sev ali B 1.525 je podoben že znanim sevom, ima pa kar nekaj mutacij, ki so lastne samo njemu.
Vir slike: LBC

B 1.525 so prvič odkrili z zaporedjem genoma sredi decembra 2020 v Nigeriji. Hitro se je razširil v Združeno kraljestvo, Francijo … Po slabih dveh, treh mesecih od odkritja seva B.1.525 je ta predstavljal več kot 20 % genomov, prepoznanih v Nigeriji. Po vsem svetu so ga odkrili v več kot 200 primerih.

Trenutno je znano zgolj to, da se hitreje širi, da se lahko z njim okužijo tudi tisti, ki so covid preboleli, in tisti, ki so bili cepljeni z vsemi določenimi odmerki.

Aminokislinski substituciji Q52R in A67V se nahajata v N-terminalni domeni beljakovinskega proteina, prav tako tudi mutacije na mestu 69-70 in 144. Zato sta za sev značilni dve točkovni mutaciji. Obe sta identični britanski različici B.1.1.7. Mutacijo na mestu 69-70 najdemo tudi v več naravno prisotnih različicah.

Za domeno N-terminala še ni dodeljena nobena posebna lastnost. Načeloma večina mutacij na tem mestu ni škodljiva in nove lastnosti ne predvidevajo hitrejšega širjenja ali celo imunosti na cepiva. Primarni učinek mutacij na tem delu je običajno zgolj »lepotni popravek«.

Zamenjava aminokislin na mestu 888 je v membransko-proksimalnem predelu stebla beljakovine, podobna je spremembi na položaju 870, ki jo najdemo pri nevtralizacijskih mutacijah, ki nimajo posebnih lastnosti oziroma niso nevarne za človeka, za hitrejše ali agresivnejše širjenje.

Mutacije nigerijskega seva.
Mutacije nigerijskega seva.
Vir slike: Forbes

Mutacije v nigerijskem sevu

Nigerijski sev ima še mutacijo D614G, ki povzroča večjo prenosljivost in je na tej stopnji prisotna v skoraj vseh različicah SARS-CoV-2. Mutacija nigerijskega seva E484K je prisotna tudi v južnoafriškem in brazilskem sevu. Mutacija E484K je približno trikrat odpornejša na več cepiv proti covidu-19 in desetkrat odpornejša na večino rekonvalescentnih protiteles.

Mutacija aminokislin na položaju 677 (Q677H) je enaka tisti, ki jo najdemo v različicah, nedavno odkritih v Ameriki. Te mutacije se pojavijo v delu S1 beljakovine spike. Mutacija D614G, ki je prav tako prisotna v nigerijskem sevu, ima zmožnost večje prenosljivosti.

Nigerijski sev ima še mutacije v ORF1a NSP3: NSP6: (delecija treh aminokislin 106–108) in eno v ORF1b NSP12: (P323F), torej v glavni RNA. Štiri mutacije ima v genih, ki določajo virusne strukturne beljakovine E: (l21F), M: (I82 F) in N: (A12G) in (T208I). Omeniti velja, da se večina teh mutacij pojavi v transmembranskih beljakovinah NSP6, E, M in da je protein N zelo antigen pri ljudeh, okuženih s SARS-CoV-2.

Vse te mutacije lahko pripomorejo k temu, da se okuži tudi oseba, ki je covid že prebolela. Preostale različice ORF1a pa lahko povečajo prenosljivost in odpornost na cepivo.

Mutacije nigerijskega seva.
Mutacije nigerijskega seva.
Vir slike: Forbes

Z vsako novo različico prihajajo bolj niansirane mutacije, ki pripomorejo k hitrejšem širjenju virusa. Trenutni sevi imajo to lastnost, da se bistveno hitreje širijo (tudi do 78 %), hkrati pa so odporni na trenutno znana cepiva.

Čeravno si vsi želimo, da bi se ukrepi sprostili, da bi lahko odšli s prijatelji v miru na kavo, pivo, karkoli v lokalno gostilno, pa trenuten trend naraščanja različnih sevov v ospredje postavlja vprašanje, če je sproščanje smiselno. Žal nas trenutno pred hitrim širjenjem virusa in vseh sevov varuje le omejitev stikov.

Na žalost vsak nov sev vključuje odpornost na cepivo, hitrejši prenos, odpornost na že izoblikovano zaščito imunskega sistema ter je z vsako novo mutacijo močnejši in nas ljudi postavlja v podrejeno vlogo. Kdo bo v tej bitki zmagal? Dokler ne bomo skupili skupaj, bomo vsakič, ko bomo menili, da smo že na dobri poti, dobili udarec ter se znašli v novem valu nepredstavljivega širjenja virusa.  

Subscribe
Notify of
guest
0 Komentarji
Inline Feedbacks
View all comments

Prijava na e-novice